杨猛,1982年06月出生,校聘教授,研究生学历,博士学位,硕士研究生导师,主要研究方向为基于群体基因组学、泛基因组学等手段挖掘枣的优良性状相关基因及功能验证。
教育背景
2011/09~2016/12 中国科学院北京基因组研究所 生物信息学 博士
2006/09~2008/06 浙江大学 生物信息学 硕士
2002/09~2006/06 安徽大学 生物技术 本科
工作经历
2020.06~至今 河北农业大学园艺学院,枣中心
2018.10~2020.05 北京希望组/武汉未来组生物科技有限公司
2008/08~2018.9 中国科学院北京基因组研究所
其中2008/08-2010/12, 外派沙特阿拉伯参与中沙合作的椰枣基因组项目
荣誉称号
2020年,“太行学者三层次”,河北农业大学
科研项目
1. 国家自然科学基金青年基金,基于胎儿游离DNA的高通量微单倍型测序的法医学探索研究,第一。
2. 国家重点研发计划之子课题“泥土微生物DNA二代测序数据分析方法研究”,第一。
3. 国家自然科学基金面上项目,南极适冷菌Psychrobacter sp. G温度与盐度胁迫下基因表达谱分析及冷/热激基因应答机制研究,第四。
论文著作
· Zhuang W*#, Chen H*, Yang M*, Wang J*, Pandey MK, Zhang C, Chang WC, Zhang L, Zhang X, Tang R et al: The genome of cultivated peanut provides insight into legume karyotypes, polyploid evolution and crop domestication. Nat Genet 2019, 51(5):865-876.
· Zhang QX*, Yang M*, Pan YJ, Zhao J, Qu BW, Cheng F, Yang YR, Jiao ZP, Liu L, Yan JW: Development of a massively parallel sequencing assay for investigating sequence polymorphisms of 15 short tandem repeats in a Chinese Northern Han population. Electrophoresis 2018, 39(21):2725-2731.
· Xiao XH*, Yang M*, Sui JL, Qi JY, Fang YJ, Hu SN, Tang CR: The calcium-dependent protein kinase (CDPK) and CDPK-related kinase gene families in Hevea brasiliensis-comparison with five other plant species in structure, evolution, and expression. FEBS open bio 2017, 7(1):4-24.
· Yang M*, Yin C*, Lv Y, Yang Y, Chen J, Yu Z, Liu X, Xu M, Chen F, Wu H et al: Development of a rapid 21-plex autosomal STR typing system for forensic applications. Electrophoresis 2016, 37(21):2789-2799.
· Tang C#*, Yang M*, Fang Y*, Luo Y*, Gao S, Xiao X, An Z, Zhou B, Zhang B, Tan X et al: The rubber tree genome reveals new insights into rubber production and species adaptation. Nature plants 2016, 2(6):16073.
· Yang M*, Zhang X, Liu G, Yin Y, Chen K, Yun Q, Zhao D, Al-Mssallem I, Yu J: The complete chloroplast genome sequence of date palm (Phoenix dactylifera L.). PloS one 2010, 5(9):e12762.
· Yang M*, Song S, Liu G, Chen K, Tian X, Zhao Z, Hu S, Yu J: A comprehensive analysis of protein phosphatases in rice and Arabidopsis. Plant Systematics and Evolution 2010, 289(3-4):111-126.
· Peng Wang, Yingfeng Luo, Jianfeng Huang, Shenghan Gao, Guopeng Zhu, Zhiguo Dang, Jiangtao Gai, Meng Yang et al., The genome evolution and domestication of tropical fruit mango., Genome biology, 2020, 6:20.
· Jing Chen, Bingbing Xie, Yaran Yang, Meng Yang et al. , Geneti c variability and forensic efficiency of 39 microsatellite loci in the Li ethnic group from Hainan Island in the South China Sea., Ann Hum Biol, 2016.11.13, 1~8.
· Shuai Wang, Sen Wang, ..., Meng Yang et al., Comparative genomics reveals adaptive evolution of Asian tapeworm in switching to a new intermediate host., Nat Commun, 2016.9.22, 7: 12845~12845.
· Yongjun Fang, Hailiang Mei, Binhui Zhou, Xiaohu Xiao, Meng Yang, Yacheng Huang, Xiangyu Long, Songnian Hu, Chaorong Tang, De novo Transcriptome Analysis Reveals Distinct Defense Mechanisms by Young and Mature Leaves of Hevea brasiliensis (Para Rubber Tree)., Sci Rep, 2016.9.13, 6: 33151~33151.
· Xiaohu Xiao, Chaorong Tang, Yongjun Fang, Meng Yang et al., Structure and expression profile of the sucrose synthase gene family in the rubber tree: indicative of roles in stress response and sucrose utilization in the laticifers, FEBS Journal, 2014.1.01, 281 (1): 291~305.
· Piyatrakul P, Yang M, Putranto R, Pirrello J, Dessailly F, Hu S, Summo M, Theeravatanasuk K, Leclercq J, Kuswanhadi et al: Sequence and expression analyses of ethylene response factors highly expressed in latex cells from Hevea brasiliensis. PloS one 2014, 9(6):e99367.
· Liu P, Cheng Y, Yang M, Liu Y, Chen K, Long CA, Deng X: Mechanisms of action for 2-phenylethanol isolated from Kloeckera apiculata in control of Penicillium molds of citrus fruits. BMC microbiology 2014, 14:242.
· Che S, Song L, Song W, Yang M, Liu G, Lin X: Complete Genome Sequence of Antarctic Bacterium Psychrobacter sp. Strain G. Genome announcements 2013, 1(5).
· Ibrahim S. Al-Mssallem,... Meng Yang et al., Genome sequence of the date palm Phoenix dactylifera L, Nature Communications, 2013.8.01, 4.
· Virginie Gebelin, ... Meng Yang et al., The small RNA profile in latex from Hevea brasiliensis trees is affected by tapping panel dryness, Tree Physiology, 2013.10.01, 33 (10): 1084~ 1098.
· Yongjun Fang, Hao Wu, Tongwu Zhang, Meng Yang et al., A Complete Sequence and Transcriptomic Analyses of Date Palm (Phoenix dactylifera L.) Mitochondrial Genome, PLos One, 2012.5.24, 7 (5)
· Chen K, Wang L, Yang M, Liu J, Xin C, Hu S, Yu J: Sequence signatures of nucleosome positioning in Caenorhabditis elegans. Genomics, proteomics & bioinformatics 2010, 8(2):92-10
发明专利
· 专利号: CN106086223B;名称:一种基于ZNA引物的STR分型系统试剂盒;第三发明人
· 专利号: CN106048053B;名称:基于高通量测序的38个STR等位基因的检测试剂盒;第二发明人
· 专利号: CN106048053B;名称:基于高通量测序的40个STR等位基因的检测试剂盒;第二发明人
· 专利号: CN106086210B;名称:基于高通量测序的35个STR等位基因的检测试剂盒;第二发明人
· 专利号: CN106222258B;名称:基于高通量测序的38个STR等位基因的检测试剂盒;第二发明人
· 专利号: CN105969905B;名称:基于21个线粒体SNP位点的法医学快速检测试剂盒;第三发明人
· 专利号: CN105483262B;名称:一种基于高通量测序的10个STR位点的检测试剂盒;第二发明人
学术会议报告及摘要
· 报告题目:Advanced applications of long fragment sequencing technology in plants (英文报告)
会议信息:2019国际橡胶树基因组学专题研讨会,中国热带农业科学院与国际天然橡胶研究与发展委员会(IRRDB)联合举办,2019.08.05,海南澄迈。
· 报告题目:Third generation sequencing and its applications in plants
会议信息:第三届北京大学-中国农业科学院现代农业生物技术研讨会,2018.12.29,香山饭店。
· 报告题目:Third generation sequencing and its applications in animals
会议信息:动物遗传育种及健康养殖学术研讨会,2018.11.16, 长沙
· 报告题目:Oxford nanopore sequencing technology and its applications (英文报告)
会议信息:基因组学前瞻:信息获取、智慧医疗、测序新技术进展研讨会,2018.09.29,沈阳。
· Poster presentation:A genome survey of the flowering plant Paris japonica – the largest known genome on planet earth
会议信息: Plant & Animal genome conference, San Diego, USA, 2018.1.11
· 报告题目:A complete chloroplast genome sequence of the date palm (Phoenix dactylifera L.) (英文报告)
会议信息:The 6th Internation Date Palm Conference, 2009, Emirates Palace Hotel, Abu Dhabi.
团队和平台
遗传育种系
中国枣研究中心
联系方式
联系电话:0312-7528962
电子邮件:yangm@hebau.edu.cn